Naudojant mufelinę krosnį, ją eksploatuoti turi profesionalai, o neprofesionalams griežtai draudžiama ja naudotis privačiai.
Kai kaitinama mufelinė krosnis, krosnies apvalkalas taip pat įkaista, todėl krosnį laikykite toliau nuo degių medžiagų, o krosnies išorę laikykite lengvai išsklaidytą šilumą.
Krosnies temperatūra naudojimo metu neturi viršyti maksimalios mufelinės krosnies temperatūros, kad nesudegtų elektrinis kaitinimo elementas arba nekiltų pavojus.
Atliekant deginimo bandymą, mėginys turi būti visiškai karbonizuotas elektrinėje krosnyje, prieš įdedant į pelenų krosnį, kad nesusikauptų anglis ir nepažeistų kaitinimo elemento.
Naudojant mufelinę krosnį, būtina išlaikyti krosnį švarią ir laiku pašalinti nešvarumus, tokius kaip oksidai.
Pabaigus šildymą reikia atjungti maitinimą, kad jis natūraliai atvėstų, kad neatsidarytų krosnies durelės ir krosnis staiga neatšaltų ir nesugestų, o jei reikia skubiai atidaryti, galite atidaryti nedidelį pirmiausia įlaužkite, o tada atidarykite krosnies dureles, kai temperatūra nukrenta žemiau 200 laipsnių, ir atkreipkite dėmesį į saugumą imdami mėginį, saugokitės nusiplikymo.